Embora a vacina contra o HPV seja actualmente segura e a maioria das pessoas não apresente quaisquer anomalias, um número muito pequeno de pessoas pode sofrer de alergias, febre, vermelhidão, inchaço e dor. Há um processo pelo qual o corpo reage à vacinação, e a gravidez precoce é prejudicial para o crescimento e desenvolvimento do feto. Além disso, após a gravidez, a resistência do corpo diminui naturalmente, o que pode afectar a eficácia da vacinação e levar ao fracasso. São necessárias três vacinações consecutivas, e todo o processo dura seis meses. Para o bem da saúde do seu bebé, é importante utilizar bons contraceptivos e recomenda-se que comece a contar a partir do momento da última vacinação.