A maior parte do que é introduzido no dente para o primeiro tratamento de canal é medicação para inativação da polpa ou medicação anti-séptica para desinfeção do canal radicular. A terapia do canal radicular é um tratamento de rotina para a endodontite ou inflamação periapical. No caso da endodontite, a inativação da polpa, vulgarmente conhecida como destruição do nervo, é realizada durante o primeiro tratamento do canal radicular com inactivadores da polpa, que são medicamentos que destroem o nervo. Dependendo da duração da ação do medicamento, é determinado o tempo para o segundo acompanhamento. No caso da periodontite apical crónica, a preparação do canal radicular é seguida da desinfeção do canal radicular, que é normalmente efectuada com um desinfetante do canal radicular à base de hidróxido de cálcio. Alguns podem também ser preparados com hidróxido de cálcio e iodofórmio. Assim, a medicação colocada no dente para o primeiro tratamento do canal radicular está relacionada com a doença do próprio dente, principalmente agentes desactivadores para a pulpite e medicamentos desinfectantes do canal radicular para a periodontite periapical, o que requer uma visita ao dentista.