A toma de cloridrato de berberina pode afetar os resultados de alguns exames médicos, como o teste respiratório de carbono 14. Em geral, a maioria dos resultados dos exames médicos não é afetada. A principal função do cloridrato de berberina é anti-inflamatória e antibacteriana, prevenindo e controlando infecções, sendo geralmente utilizado no tratamento de doenças infecciosas do trato gastrointestinal, como a disenteria bacilar e a gastroenterite, e, além disso, pode também ser utilizado no tratamento da Helicobacter pylori. Por conseguinte, quando o cloridrato de berberina é utilizado para tratar a Helicobacter pylori, se o teste respiratório do carbono 14 for efectuado sem parar a medicação, o resultado pode ser afetado. O cloridrato de berberina, por si só, tem menos efeitos secundários e menos reacções adversas orais. No entanto, ocorrem ocasionalmente reacções adversas, como náuseas, vómitos e erupções cutâneas, que geralmente desaparecem gradualmente após a interrupção do medicamento. O medicamento deve ser administrado sob a orientação de um médico, não sendo recomendada a sua toma por via oral. Além disso, se existir alguma doença relacionada, recomenda-se a ida ao hospital para esclarecer a causa e tratar os sintomas sob a orientação de um médico.