A principal causa da amigdalite aguda é uma infecção viral ou bacteriana. Se for devida a uma infecção viral, não é necessário nenhum tratamento especial, uma vez que a infecção é autolimitada e recomenda-se beber muita água, fazer uma dieta leve e descansar. Se a infecção for bacteriana, os organismos causadores mais comuns são os cocos gram-positivos, tais como estreptococos. A penicilina ou uma geração de cefalosporinas é o tratamento preferido, e estes medicamentos estão disponíveis para as mulheres que estão a amamentar. Quer a amigdalite seja causada por bactérias ou vírus, não é aconselhável o uso de medicamentos por conta própria. Recomenda-se que os testes de sangue de rotina sejam completados primeiro, e depois a natureza da infecção seja esclarecida de acordo com os resultados dos testes de sangue, e depois a medicação apropriada seja administrada.