Se o rastreio da síndrome de Down no início da gravidez indicar um risco elevado, recomenda-se a realização de uma amniocentese ou de um teste de ADN não invasivo para obter um diagnóstico definitivo. Um risco elevado de síndrome de Down indica uma elevada probabilidade de o feto ter síndrome de Down, mas não há certeza de síndrome de Down. A amniocentese e os testes de ADN não invasivos têm uma precisão superior a 99%, mas a amniocentese tem um factor de risco elevado e deve ser realizada num hospital de grande dimensão com internamento. O teste de ADN não invasivo é um teste de sangue não invasivo que não causa traumas ao feto ou à mulher grávida e é mais preciso no diagnóstico da síndrome de Down. As mulheres grávidas podem escolher de acordo com a sua situação e também decidir se querem manter o feto com base nos resultados, sob a orientação do seu médico. Recomenda-se que as mulheres grávidas façam os testes adequados atempadamente durante a gravidez e se submetam ao rastreio da síndrome de Down entre as 16 e as 18 semanas de gestação para evitar defeitos congénitos no feto e para conseguir uma reprodução eugénica.