A doxiciclina é um medicamento utilizado para tratar algumas infecções quando alguns microrganismos patogénicos infectam o corpo e os sintomas correspondentes aparecem. A doxiciclina é também selectiva e é geralmente utilizada para tratar infecções tais como micoplasma e clamídia, e as infecções por rickettsia e espiroquetas são também frequentemente escolhidas para a doxiciclina. Para a brucelose, a doxiciclina também pode ser usada, mas geralmente em combinação com rifampicina ou outros medicamentos, que não são muito eficazes por si sós. A doxiciclina pode ser tomada por via oral, é relativamente barata e é uma opção quando estão presentes infecções por Mycoplasma pneumoniae e Chlamydia pneumoniae. A doxiciclina também é perfeitamente boa quando são escolhidas infecções por lyso-urea ureaplasma e Chlamydia trachomatis, que frequentemente levam a infecções geniturinárias. A febre de regressão e os espiroquetas também são opções, tal como outras febres de mordedura de ratos e o châncreas mole. A doxiciclina é também uma opção para a sífilis se for alérgico à penicilina.