Se o tratamento da meningite purulenta neonatal for atempado e bem sucedido, a lesão do parênquima cerebral é ligeira e pode não afetar a inteligência; se a lesão do parênquima cerebral for mais grave, pode deixar muitas sequelas, como a audição, a inteligência, a locomoção, a linguagem, etc. A meningite purulenta neonatal é causada por infeção bacteriana no crânio, se apenas as meninges estiverem infectadas, após tratamento ativo, com o crescimento e desenvolvimento da criança, a maioria das crianças não ficará com deficiência intelectual. Se a lesão do parênquima cerebral for mais grave, pode causar regressão intelectual, sendo necessária uma reabilitação ativa, a permanência intelectual específica de alguns anos, com o grau de lesão cerebral, o processo de tratamento e a posterior reabilitação estão relacionados. Quando se suspeita de meningite séptica em recém-nascidos, recomenda-se que sejam hospitalizados a tempo de serem tratados e que sejam ativamente reabilitados durante o período de recuperação, a fim de reduzir a incidência de sequelas.