A dor na área do apêndice, se não for apendicite, também pode ser inflamação do apêndice. Em pacientes com colite ulcerosa e doença de Crohn, doenças inflamatórias crónicas do intestino, que também apresentam dor abdominal, inchaço, diarreia, náuseas e vómitos, é normalmente realizada uma inércia de bário ou colonoscopia do tracto digestivo para fazer um diagnóstico claro. Os pacientes com dor abdominal recorrente e sintomas relacionados devem ser tratados sistematicamente para prevenir complicações e, em casos de colite ulcerosa, devem ser administrados imunossupressores orais e aminossalicilatos. Os tumores na região ileocecal podem também apresentar sintomas semelhantes à dor abdominal inferior direita e precisam de ser monitorizados. A colonoscopia pode detectar ainda mais lesões neoplásicas ou ocupantes no intestino. Esta doença também precisa de ser diferenciada da apendicite, uma vez que o tratamento cirúrgico também é necessário se necessário.