Os efeitos secundários dos comprimidos de cloridrato de betaistina incluem vasoespasmo abdominal, dor abdominal, náuseas, vómitos, dores de cabeça e rubor facial. Estes efeitos secundários ocorrem principalmente porque é um derivado da histamina, um vasodilatador, e pode ajudar eficazmente a aliviar os sintomas de tonturas e vertigens, especialmente na circulação da microvasculatura do ouvido interno. Devido a estes efeitos secundários, deve ser utilizado com precaução. Evitar alimentos picantes e oleosos na dieta, especialmente em doentes com úlceras pépticas e asma brônquica, uma vez que podem causar exacerbação da condição. Além disso, pode provocar um aumento da tensão arterial em doentes com tumores medulares supra-renais dos rins. Este medicamento pode passar para o corpo de crianças pequenas através do leite materno, pelo que deve ser utilizado com precaução em mulheres a amamentar.