A atrofia da íris é geralmente difícil de reparar através de cirurgia.
Atualmente, não existe nenhum tratamento eficaz para a atrofia da íris na clínica, sendo geralmente necessário tratar as doenças primárias que causam a atrofia da íris, como a irite e o glaucoma, para evitar o agravamento persistente da atrofia. A atrofia ligeira da íris tem menos impacto no doente e é muitas vezes difícil de detetar, não necessitando geralmente de tratamento.
A atrofia moderada e grave da íris pode causar desconforto, como fotofobia e visão dupla, e não foi encontrado nenhum tratamento para reparar a íris atrofiada. Se o doente tiver um desconforto significativo, a implantação cirúrgica de uma íris artificial pode ser utilizada para aliviar o desconforto do doente.
Recomenda-se que os doentes com atrofia significativa da íris procurem assistência médica imediata para avaliar o seu estado e sigam as instruções do médico para o tratamento.