Os níveis baixos de ApoE devem-se a uma função hepática deficiente e a quantidade adequada de estrogénio no corpo de uma mulher também pode afectar os níveis de ApoE. A falta de ingestão de nutrientes numa dieta a longo prazo também pode causar uma diminuição do teor de gordura corporal. As doenças do fígado, como a hepatite, a cirrose e o fígado gordo, podem afectar os níveis de ApoE, que são normalmente observados no fígado gordo. Os níveis de apolipoproteína podem ser medidos para avaliar a função do fígado. A libertação de estrogénios nas mulheres também pode afectar indirectamente a função hepática e causar cirrose, conduzindo a níveis baixos de Apo. Níveis baixos de apolipoproteína podem levar a doenças cardiovasculares, o que pode aumentar a incidência de doença coronária e é prejudicial para a manutenção da elasticidade vascular.