Possíveis causas de cardiomiopatia hipertrófica: 1, geralmente e relação genética, pode ser causada por um número de mutações de um único gene, até agora foi encontrado para ter 7 genes, mais de 70 tipos de mutações relacionadas com a doença, o mais caraterístico dos quais está localizado no cromossomo 14 mutação do gene da cadeia pesada da miosina causada pelas diferentes mutações genéticas resultando em manifestações clínicas de cardiomiopatia hipertrófica e prognóstico também são diferentes; 2, o período fetal de produção de catecolaminas A produção excessiva de catecolaminas ou a atividade aumentada no período fetal podem levar a distúrbios do arranjo dos cardiomiócitos, bem como à hipertrofia assimétrica do septo interventricular; 3, baixa concentração de íons cálcio, aumento da tensão do miofilamento, aumento da capacidade de contração da fibra muscular, que pode induzir hipertrofia miocárdica, mas a etiologia específica não é muito clara.