A taxa de sucesso dos ciclos artificiais e naturais é relativamente a mesma, especialmente se o estado do organismo for normal. No entanto, no caso de uma função ovárica anormal, a taxa de sucesso dos ciclos naturais é relativamente mais elevada. Se o estado do organismo for normal, por exemplo, um ciclo menstrual normal, um nível hormonal normal no organismo, etc., a taxa de sucesso do transplante num ciclo artificial e num ciclo natural é praticamente a mesma. No entanto, para as pessoas com uma função ovárica anormal, o transplante não pode ser efectuado através de ciclos naturais, sendo necessário recorrer a hormonas exógenas para ajustar o ciclo e sincronizar o endométrio com os níveis hormonais do organismo, de modo a facilitar o transplante. A utilização de medicamentos num ciclo artificial pode afetar o ambiente endometrial, limitando o crescimento e o desenvolvimento do embrião. Em contrapartida, os ciclos naturais têm geralmente um melhor funcionamento dos ovários e não requerem a utilização de medicamentos para intervir no tratamento, tornando o ambiente endometrial mais propício ao crescimento dos embriões. Por isso, a taxa de sucesso da implantação do ciclo natural é relativamente maior. Recomenda-se que, após a consulta médica, combinada com a condição do próprio paciente, os resultados de itens relevantes, etc., para formular um método adequado para si, mais pode melhorar a taxa de sucesso.