O tratamento mais comum para a atrofia luteal é suplementar o défice de progesterona no corpo, geralmente com injecções intramusculares de progesterona e progesterona oral na ampola, e também com gonadotropina coriónica para promover a função luteal. I: Terapia de suplementação com hormonas luteinizantes. Com início 8-10 dias antes do próximo período menstrual, progesterona 20mg intramuscularmente ou progesterona 10mg por via oral diariamente durante 7-10 dias. Funciona regulando a função de feedback do eixo hipotálamo-hipófise-ovariano, resultando na atrofia oportuna do corpo lúteo e num desprendimento mais completo do endométrio. 2: Gonadotropina coriónica. A gonadotropina coriónica é normalmente aplicada para promover e apoiar a função luteal. A injecção intramuscular de HCG 2000-3000 U de dois em dois dias por 5 vezes, começando após o aumento da temperatura basal do corpo, pode levar a um aumento acentuado da progesterona e ao subsequente recomeço dos ciclos menstruais normais.