A hiperplasia quística do endométrio deve ser tratada ou não, consoante o caso. No caso de uma hiperplasia assintomática, bastam exames regulares, ao passo que uma hiperplasia incómoda pode exigir um tratamento prescrito pelo médico. A hiperplasia endometrial classifica-se em simples, complexa e atípica. A hiperplasia endometrial quística é uma hiperplasia endometrial simples. Existe um continuum de alterações patológicas desde a hiperplasia simples do endométrio até à hiperplasia atípica do endométrio e depois ao cancro do endométrio altamente diferenciado, sendo a hiperplasia atípica do endométrio uma lesão pré-cancerosa do cancro do endométrio. Em pacientes de alto risco com sangramento uterino anormal prolongado, anovulação, obesidade e uso de estrogênio exógeno, o risco de câncer aumenta, e a terapia com progestina é recomendada para corrigir o sangramento uterino anormal, reverter o endométrio e prevenir o câncer endometrial. Por conseguinte, é necessário tratamento para a hiperplasia quística do endométrio com sintomas, mas para a hiperplasia assintomática, é necessária uma revisão regular para garantir o controlo da progressão da doença e recomenda-se a consulta de um profissional de saúde para formular um plano de tratamento.