As principais causas de enjoos matinais nas crianças incluem o seguinte: em primeiro lugar, devido a perturbações gastrointestinais. Se as crianças sofrem de perturbações gastrointestinais, sofrerão de náuseas, vómitos e mesmo diarreia, que podem ser reguladas com probióticos, tais como a aplicação de leite de Mamma para crianças. Em segundo lugar, sintomas causados por crianças que sofrem de gastrite crónica. Se houver infecção por H. pylori, a bactéria atacará o estômago da criança, causando inflamação crónica do estômago, e a criança experimentará também vómitos matinais, acompanhados de dor no estômago e no epigástrio, bem como dores significativas de manhã. Para a infecção por H. pylori, as crianças precisam de ser tratadas com medicamentos como omeprazol e amoxicilina.