A limpeza intestinal é necessária antes da colonoscopia e as alternativas à limpeza com água eletrolítica incluem Senna, Sulfato de Magnésio, Manitol, Lactulose e uma nova classe de Picolinato de Sódio composto, mas cada um tem as suas próprias vantagens e desvantagens. A enteroscopia é uma operação invasiva, a limpeza intestinal é mais útil ao médico para verificar se existe uma lesão e para recolher material. O senna e o sulfato de magnésio, que eram utilizados nos primórdios da colonoscopia, já não são muito utilizados devido aos maus resultados obtidos em alguns doentes. A laxação de manitol pode produzir gás, o processo de exame comum geralmente faz electrocauterização endoscópica, eletrocoagulação e outras operações, este tempo pode ser perigoso, portanto, a aplicação atual de manitol é rara. A lactulose também pode ser utilizada como agente de limpeza intestinal, mas o efeito varia de pessoa para pessoa. O dispersante eletrolítico composto de polietilenoglicol é o laxante mais utilizado, que contém electrólitos formulados de acordo com a fórmula, de modo que, quando os doentes o tomam, raramente têm distúrbios electrolíticos, e o medicamento tem poucos efeitos secundários, e tem pouco efeito em doentes idosos e na função hepática e renal. No entanto, o medicamento tem de ser diluído com uma grande quantidade de água antes de ser tomado, o sabor não é bom e alguns doentes podem sentir náuseas e vómitos depois de tomarem o medicamento. A nova classe de laxantes, como o picolinato de sódio composto, que é tomado em doses mais pequenas e pode ser tomado com água adicional, é também uma boa escolha. A escolha dos laxantes deve ser feita sob a avaliação e orientação exaustivas do médico, para evitar que uma limpeza incompleta afecte os resultados dos testes.