A quimioterapia ainda pode ser prejudicial para o corpo, pelo que é geralmente necessário avaliar a condição física do paciente e se ele ou ela pode tolerá-la antes da quimioterapia. Os medicamentos de quimioterapia são citotóxicos e têm um impacto significativo nos órgãos, tais como o coração, o fígado e a função renal. Os doentes com doenças crónicas do fígado ou dos rins ou com funções cardíacas deficientes devem ser avaliados antes da administração da quimioterapia para avaliar se a podem tolerar. Os medicamentos citotóxicos também podem ter um efeito supressor na medula óssea, como evidenciado por uma diminuição dos leucócitos e plaquetas do sangue periférico, e podem mesmo causar anemia. A leucopenia pode levar à imunodeficiência, o que pode levar a infecções graves e pode mesmo ser fatal, e a trombocitopenia pode levar a hemorragias, que são complicações graves da quimioterapia. Os medicamentos de quimioterapia têm um maior impacto no tracto gastrointestinal e as náuseas e vómitos ocorrem normalmente durante a quimioterapia. Com a crescente maturidade da tecnologia da quimioterapia e a melhoria dos medicamentos quimioterápicos ao longo das gerações, o impacto no funcionamento dos órgãos tem sido gradualmente reduzido. Além disso, existem vários medicamentos de apoio na quimioterapia, tais como medicamentos anti-eméticos ou medicamentos para prevenir a toxicidade do coração, fígado e rins, que podem assegurar que os pacientes podem passar pela quimioterapia com segurança. Portanto, embora a quimioterapia tenha um impacto no corpo, continua a ser um tratamento eficaz para tumores malignos.