Quando acabou de ter o seu período, embora o endométrio seja derramado mais lentamente e a hemorragia seja muito baixa, ter relações sexuais neste momento ainda pode ter algum efeito. Pode haver inflamação endometrial, doença inflamatória pélvica e inflamação das trompas de falópio porque a cavidade da trompa de falópio e a cavidade uterina estão ligadas. Quando o endométrio é expelido, o endométrio atinge a cavidade pélvica com o balanço da cílios, provocando a endometriose. Pode também causar febre alta, dores abdominais e possivelmente até uma menstruação gota-a-gota. Quando isto acontece, é importante ir ao hospital para ser examinado e ter tratamento anti-inflamatório e hemostático. Durante a menstruação, os genitais do parceiro masculino podem estar carregados de bactérias, e a relação sexual neste momento pode também resultar em infecção cruzada, especialmente se não for observada uma boa higiene durante a menstruação, e pode ter vaginite.