Para saber como funciona a pomada de ácido fusídico para se livrar da acne, é preciso primeiro compreender a patogénese da acne. A acne é uma doença inflamatória crónica das glândulas sebáceas dos folículos pilosos. Está principalmente relacionada com andrógenos, glândulas sebáceas e infecções como a acne de Propionibacterium. Quando os canais sebáceos dos folículos pilosos se abrem anormalmente, o sebo produzido pelas glândulas sebáceas acumula-se nas glândulas sebáceas, onde as bactérias Propionibacterium acnes e Staphylococcus epidermidis nas glândulas sebáceas decompõem o sebo, causando ácidos gordos livres, que irritam ainda mais os folículos pilosos e as glândulas sebáceas e levam à inflamação. A pomada de ácido fusídico é uma pomada antibiótica que mata tanto Propionibacterium acnes como Staphylococcus epidermidis. Quando estas bactérias são mortas, não decompõem o sebo, aliviando assim a inflamação das glândulas sebáceas.