Os doentes com embolia mesentérica podem sentir dor abdominal, inchaço, náuseas e perda de apetite nas fases iniciais. Os doentes com embolia mesentérica sofrem geralmente de fibrilhação auricular, o que leva à deslocação de coágulos sanguíneos da parede ventricular, que podem bloquear os vasos sanguíneos mesentéricos juntamente com a circulação sanguínea, resultando em isquémia e mesmo necrose de parte do tubo intestinal, manifestando assim uma série de manifestações clínicas. Na fase inicial, devido ao seu trato gastrointestinal, o mesentério não está completamente necrosado, mas apenas apresenta alguns sintomas de isquemia, que se podem manifestar como disfunção digestiva, como dor abdominal, distensão abdominal, náuseas, perda de apetite, etc., e quando grave, o doente terá uma série de manifestações clínicas, como pressão arterial baixa sistémica, choque infecioso, febre sistémica, etc. Por conseguinte, as pessoas com fibrilhação auricular e trombofilia que correm um risco elevado de desenvolver embolia mesentérica devem consultar um médico atempadamente quando estes sintomas ocorrem, de modo a melhorar o exame, detetar a embolia mesentérica e tratá-la em conformidade.