O nível baixo de HDL pode não se manifestar, alguns doentes podem ter tonturas e, em casos graves, pode ocorrer enfarte cerebral e enfarte do miocárdio. Os níveis baixos de HDL reduzem a capacidade de transporte, o que pode levar ao aumento dos níveis de colesterol total e de LDL e promover a progressão da aterosclerose. Os doentes com níveis baixos de HDL podem não ter quaisquer manifestações clínicas, mas apenas resultados laboratoriais anormais. Em alguns doentes, a aterosclerose pode provocar tonturas e aperto torácico, enquanto a aterosclerose grave pode provocar enfarte cerebral com diminuição dos movimentos dos membros e o enfarte do miocárdio pode provocar dor e aperto torácico. Os doentes com HDL baixo devem prestar atenção à monitorização do LDL e do colesterol total e, se necessário, devem receber medicação com base no controlo dietético, como a atorvastatina oral e outros medicamentos.