Os tubos para nebulização podem ser limpos com uma solução desinfetante, mas têm de ser enxaguados com água e secos em seguida. A limpeza dos tubos de nebulização com uma solução desinfetante é relativamente segura e é a forma correcta de os desinfetar, mas é necessário seguir as instruções para preparar uma solução desinfetante ou utilizar diretamente uma solução desinfetante com álcool a 75%. Nesta altura, normalmente, a limpeza é feita por imersão, o que pode matar completamente as bactérias presentes. Mas, após a imersão, também é necessário utilizar água para limpar o desinfetante residual no tubo, para evitar a utilização de componentes residuais de desinfetante no trato respiratório. Ao mesmo tempo, após a limpeza com água, também é necessário secar os tubos de nebulização e mantê-los ao abrigo da luz, tanto quanto possível, para evitar a sua deterioração. Embora os tubos de nebulização possam ser limpos com desinfetante, mas por razões de higiene tente fazer uma utilização exclusiva, não pode haver aplicação cruzada, recomenda-se uma utilização única após a substituição.