Os alimentos entram na boca e são decompostos pela saliva e pela amilase na boca, entrando depois no estômago através do esófago na faringe. O estômago contém não só ácido gástrico mas também suco gástrico, e o peristaltismo do estômago após a ingestão de alimentos, juntamente com a trituração inicial, digere mecanicamente os alimentos. O estômago também contém ácido clorídrico, que activa o pepsinogénio no estômago e proporciona um ambiente ácido mais adequado para a desnaturação e digestão das proteínas ingeridas. O pepsinogénio actua como agente digestivo das proteínas dos alimentos e as proteínas digeridas transformam-se em pequenas quantidades de péptidos e aminoácidos. A principal função do estômago é conseguir misturar bem os alimentos e os sucos digestivos, para que os alimentos possam ser transformados em quimo semi-líquido, que é mais propício à digestão e absorção na zona do intestino delgado.