A medicação não é adequada para crianças que são relativamente difíceis de tratar e cujos sintomas são particularmente graves, ou para crianças mais velhas. Em primeiro lugar, o autismo em si é uma perturbação do desenvolvimento que não pode ser curada diretamente com medicamentos. A medicação é, de facto, sintomática, ou seja, para certos sintomas do autismo, por exemplo, muito estereotipados. Existem três características principais do autismo: a primeira é a perturbação da interação social, a segunda é a perturbação do desenvolvimento da fala e a terceira é o comportamento estereotipado e os interesses limitados. O tratamento medicamentoso destina-se principalmente aos comportamentos específicos da criança, por exemplo, ela é muito estereotipada, semelhante à perturbação obsessivo-compulsiva, tem de fazer algo naquele estado e daquela forma, este tipo de estereotipia é muito grave e afecta a sua vida diária, podemos utilizar alguns medicamentos para a corrigir adequadamente. Além disso, algumas crianças autistas têm problemas de desatenção e de sono, pelo que também podemos utilizar alguns medicamentos. No entanto, não é verdade que o autismo possa ser curado apenas com medicação.