Se for submetida a uma colonoscopia normal, haverá mais ou menos dor e desconforto. Se for submetida a uma colonoscopia indolor, o médico administrará anestesia e, normalmente, não sentirá qualquer dor. A duração da colonoscopia, que na maioria dos casos varia entre dez minutos e cerca de uma hora, é afetada por uma série de factores.
A colonoscopia normal não necessita de anestesia, mas apenas de um laxante, o examinador tem normalmente dores e desconforto anal e abdominal. A colonoscopia indolor é efectuada sob anestesia geral e é geralmente indolor.
O tempo de operação da colonoscopia é normalmente de cerca de 10 a 20 minutos. Em casos especiais, varia normalmente entre dez minutos e cerca de uma hora. Em primeiro lugar, o tempo de anestesia varia consoante o estado físico e a situação pessoal do doente. No entanto, na maioria dos doentes, a anestesia pode ter efeito em 1-5 minutos.
Se se verificar que o doente tem pólipos ou úlceras ou ocupação, tumores e outras doenças, como neste caso especial, a necessidade de efetuar uma biópsia patológica o tempo será devidamente prolongado, variando normalmente entre 10 minutos e cerca de 30 minutos.
Se for necessário efetuar uma polipectomia microscópica ou uma elevação submucosa microscópica da ESD, o tempo de exame da colonoscopia será ainda mais longo, variando entre cerca de 30 minutos e cerca de 1 hora.
Se for necessária uma colonoscopia, esta deve ser efectuada sob a supervisão de um médico.