Depois de usar o aparelho pode ser mais difícil limpar a higiene oral, o aparelho fica manchado com muitos restos de comida, pode primeiro usar água para enxaguar a boca algumas vezes, palitos de dentes para limpar os pedaços de restos, fio dental para limpar os espaços entre os dentes e depois escovar.
Depois de comer com aparelho, deve usar água morna para limpar a boca atempadamente, enxaguar a boca mais algumas vezes, de preferência mais de 3 vezes, e enxaguar a maior parte dos resíduos alimentares na boca e nos dentes. De seguida, utilize um palito de dentes para limpar os restos de comida grandes que estão presos no aparelho, tendo o cuidado de não exercer demasiada força, o que pode provocar dores de dentes e o desprendimento do aparelho.
O fio dentário pode ser utilizado para limpar a sujidade entre os dentes vizinhos. A escovagem pode ser feita para cima e para baixo ou horizontalmente a curtas distâncias, com uma força suave para evitar riscar o aparelho.
Para além disso, existem também fios dentários profissionais. Se a escovagem não permitir uma limpeza completa, recomenda-se a utilização do fio dentário para utilizar a pressão da água para lavar os dentes.