Não existe um tratamento específico para a síndrome da boca ardente. O tratamento consiste em medicamentos locais e sistémicos, principalmente antidepressivos. 1) Medicação sistémica: o clonazepam é o fármaco de primeira linha para o tratamento da síndrome da boca ardente; os antidepressivos tricíclicos, como a amitriptilina, e os anticonvulsivantes, como a carbamazepina, também podem ser utilizados conforme adequado. Os medicamentos acima referidos podem causar sonolência, cefaleias ligeiras, mal-estar e discinesia, consoante a dose. Pessoas alérgicas são proibidas, mulheres grávidas e lactantes são proibidas. 2) Medicação tópica: Estudos demonstraram que o clonazepam na forma tópica aplicado na zona dolorosa pode aliviar o desconforto da síndrome da boca ardente. Se sofre da síndrome da boca ardente, recomenda-se que consulte imediatamente um médico. Todos os medicamentos acima referidos devem ser utilizados sob controlo médico.