Na clínica, de acordo com as diferentes fontes de células estaminais hematopoiéticas, o transplante de células estaminais hematopoiéticas divide-se em transplante autólogo de células estaminais hematopoiéticas, transplante de sangue do cordão umbilical, transplante alogénico de células estaminais hematopoiéticas, etc., e os seus preços são obviamente diferentes. Entre eles, o TCTH autólogo é utilizado principalmente no tratamento de doentes com mieloma múltiplo e linfoma. Uma vez que não existe reação de rejeição no TCTH autólogo, o custo para o doente é relativamente baixo, podendo rondar os 100 000-150 000 dólares. No caso do TCTH do sangue do cordão umbilical, uma vez que a antigenicidade das células do TCTH do sangue do cordão umbilical é relativamente fraca, a reação de rejeição dos doentes é relativamente ligeira e o custo ronda os 400 000 RMB. O mais dispendioso é o TCTH alogénico, que custa habitualmente cerca de 500.000 dólares e, no caso dos transplantes alogénicos, o doente pode ter alta do armazém por cerca de 200.000 dólares, se tudo correr bem. Nalguns casos, se ocorrerem complicações graves, pode mesmo atingir o nível de 1.000.000 de dólares. Por conseguinte, o preço do transplante de células varia significativamente consoante o tipo de transplante de células.