O abcesso hepático amebiano e o carcinoma hepatocelular têm manifestações clínicas semelhantes. O abcesso hepático amebiano precoce pode ser incorretamente diagnosticado como carcinoma hepatocelular, mas pode muitas vezes ser distinguido através de exames auxiliares. O abcesso hepático amebiano é uma complicação da infeção amebiana intestinal, que se manifesta principalmente por dor abdominal superior direita, febre, aumento do fígado e sensibilidade. Se for obtido pus típico (castanho-acastanhado) por punção hepática, ou se forem encontrados trofozoítos amebianos no pus, ou se houver um bom efeito da medicação anti-amebiana específica, então o diagnóstico de abcesso hepático amebiano pode ser confirmado. O carcinoma hepatocelular também apresenta principalmente dor na área do fígado, aumento do fígado e febre, mas o grau de febre é menor do que o do abscesso amebiano, e os sintomas geralmente pioram progressivamente, e a aplicação da terapia medicamentosa amebiana é ineficaz. Testes clínicos como medição de alfa-fetoproteína, ultrassonografia hepática, TC abdominal, varredura hepática com radionuclídeos, arteriografia hepática seletiva e ressonância magnética podem ser usados para fazer um diagnóstico claro. A punção hepática e o teste de tratamento com drogas anti-amebianas também são úteis para a diferenciação, e a história médica passada do paciente também é uma referência muito importante.