A biópsia pré-cirúrgica não é geralmente recomendada para o colangiocarcinoma ressecável; no entanto, o diagnóstico patológico é muito importante para o tratamento do colangiocarcinoma e é geralmente efectuado nos tecidos ressecados após a cirurgia. O diagnóstico patológico do colangiocarcinoma é muito importante para a escolha do plano de tratamento da doença, mas o exame pré-cirúrgico do colangiocarcinoma, especialmente para o colangiocarcinoma que pode ser ressecado radicalmente, consiste principalmente em exames imagiológicos, bem como em exames laboratoriais de sangue. É difícil efetuar uma biópsia por punção do tecido tumoral da via biliar antes da cirurgia e existe o risco de implantação do tumor e de metástases, pelo que não se recomenda a realização de biópsia antes da cirurgia. No entanto, não é verdade que o cancro da via biliar não esteja sujeito a exame patológico. O exame patológico do cancro da via biliar envolve principalmente o exame histológico dos tecidos ressecados após a cirurgia, o que é útil para os médicos formularem planos de tratamento individualizados e avaliarem o prognóstico através da análise de factores patológicos que afectam o prognóstico, tais como margens cirúrgicas, tipos e graus histológicos. Recomenda-se a cooperação com os médicos para determinar se e quando é necessária uma biopsia no caso do colangiocarcinoma.