De um modo geral, as mulheres não serão infectadas quando fizerem uma ecografia vaginal. Atualmente, quando as mulheres fazem ecografia vaginal, usam preservativos e pensos descartáveis, e são cumpridas condições de higiene rigorosas durante a operação, pelo que o exame não causa vaginite, doença inflamatória pélvica e outras infecções ginecológicas. A ecografia vaginal, em comparação com a ecografia abdominal, tem as vantagens de não ser necessário beber água para reter a urina e de o exame ser mais claro, pelo que é atualmente muito utilizada na prática clínica. Para as mulheres que ainda não são sexualmente activas, recomenda-se também que a ecografia seja realizada através do reto, a fim de tornar os resultados do exame mais precisos. Para as mulheres com perturbações menstruais e dores no baixo ventre, recomenda-se que melhorem o seu exame de ecografia ginecológica e recomenda-se também que se submetam anualmente a um exame de ecografia ginecológica para deteção precoce de lesões e tratamento precoce.