Uma perturbação no estômago após a toma da pílula é uma reacção adversa comum à pílula. Como o ingrediente principal da pílula é progestina ou uma combinação de estrogénio e progestina, pode causar reacções gastrointestinais óbvias, principalmente náuseas, vómitos, dor abdominal, inchaço e perda de apetite, etc. Estas reacções ocorrem geralmente dentro de 24 horas após a toma da pílula e irão resolver ou parar por si próprias após 24 horas. É melhor não comer qualquer alimento durante duas horas antes ou depois de tomar a pílula para reduzir as reacções gastrointestinais, e se tomar a pílula durante um longo período de tempo, deve ter-se o cuidado de não comer demasiada comida gorda. Se o desconforto estomacal persistir e não aliviar, ou mesmo piorar progressivamente, pode não estar relacionado com a pílula e deve ser verificado por um hospital para posterior diagnóstico.