O princípio da desinfecção da pele na zona cirúrgica consiste em eliminar o maior número possível de bactérias e fungos, incluindo a germinação e outros microrganismos, da superfície da pele na zona cirúrgica, sendo geralmente necessário desinfectar pelo menos 15 cm a partir da margem da incisão. Por conseguinte, no caso da cirurgia abdominal superior, o intervalo de desinfecção situa-se geralmente no limite superior da linha do mamilo, no limite inferior ao nível da sínfise púbica e na linha axilar média de ambos os lados. No caso da cirurgia do abdómen inferior, a área de desinfecção situa-se ao nível do arco costal no limite superior, no terço médio superior da coxa no limite inferior e também na linha axilar média de ambos os lados. No caso de uma incisão limpa, a desinfecção é normalmente efectuada do meio para o perímetro e, no caso de uma ferida ou ânus contaminados, do perímetro para o meio. É claro que o desinfectante difere; se for utilizado álcool de tintura de iodo para desinfectar, a desinfecção é normalmente feita uma vez com tintura de iodo e depois duas vezes com álcool, depois de a tintura de iodo ter secado completamente desiodizada; se for utilizado iodóforo para desinfectar, a desinfecção é feita duas vezes directamente na superfície da pele.