O edema intestinal geralmente não se cura por si só, mas podem ser administrados medicamentos para promover a recuperação e o edema rectal também pode ser tratado com banhos de assento. Quando o edema do trato intestinal geralmente não é capaz de recuperar por si só. Esta situação deve-se geralmente à estimulação inflamatória local, podendo ser provocada pela ingestão de alimentos estimulantes picantes, normalmente acompanhada de congestão. Esta situação pode ser tratada com medicação, como alguns inibidores da bomba de protões e antibióticos, como o omeprazol e o metronidazol. Se houver edema no reto, também se pode usar permanganato de potássio diluído ou soro fisiológico para fazer um banho de assento, que pode reduzir eficazmente a inflamação e aliviar a dor. A utilização de medicamentos deve ser efectuada sob a supervisão de um médico e não deve ser utilizada sem autorização.