Os probióticos orais não são recomendados para o tratamento de apendicite. O principal componente dos probióticos é a bifidobactéria, cujo principal objectivo é regular a flora intestinal, para que a flora intestinal desordenada possa ser reparada, aliviando assim o doente dos sintomas da colite, tais como dor abdominal e diarreia causada pela flora intestinal desordenada. A apendicite é uma doença infecciosa causada pelo bloqueio da luz apendiceal e infecção secundária da flora intestinal. O tratamento clínico requer a remoção da obstrução e o tratamento antibiótico, o que significa que a apendicectomia é a maior parte do tratamento clínico da apendicite. O uso apenas de probióticos, ou seja, bifidobactérias, não é clinicamente indicado, uma vez que não é curativo no tratamento da apendicite.