Não é recomendável beber mel com o estômago vazio, uma vez que contém muito açúcar e tem um efeito estimulante na secreção de ácido gástrico. O consumo de mel em jejum pode estimular a secreção excessiva de ácido gástrico, o que pode provocar lesões na mucosa gástrica e levar a gastrite, úlcera gástrica, úlcera duodenal, refluxo gastro-esofágico e outras perturbações digestivas, como azia, refluxo ácido e dores de estômago. Para os doentes que não têm problemas de estômago mas sofrem de obstipação, beber mel com o estômago vazio de manhã pode ser útil para aliviar a obstipação, mas não deve ser demasiado forte, excepto neste caso em que não é recomendado.