Para além das articulações, a artrite reumatoide pode danificar o coração e as lesões devidas à artrite reumatoide podem ocorrer no coração, nos pulmões, nos nervos, nos rins, nos olhos e na pele. As manifestações extra-articulares da artrite reumatoide são sinais da gravidade da artrite reumatoide ou da atividade das lesões e, por vezes, outros sintomas sistémicos fora das articulações são muito proeminentes antes do aparecimento das lesões articulares. Outros sintomas sistémicos são principalmente a pneumonite intersticial crónica (inflamação do tecido entre os alvéolos), que pode levar à formação de enfisema e fibrose pulmonar, e o sintoma mais comum é a dispneia e a falta de ar causadas pelo repouso ou após a atividade. Para além disso, a artrite reumatoide pode desenvolver pericardite adesiva antiga, miocardite, endocardite e cardite total. Se ocorrerem outros sintomas sistémicos, a doença é mais grave. A taxa de mortalidade nos doentes com artrite reumatoide com lesões viscerais é cerca de duas vezes superior à dos doentes sem manifestações extra-articulares. As principais causas de morte nos doentes com artrite reumatoide são as infecções, a doença cardiovascular e a doença renal. Em geral, as lesões articulares da artrite reumatoide são incapacitantes e raramente fatais.