Teoricamente, os dentes afectados pela cárie do biberão são os dentes de leite, que são duas séries de dentes, e quando os dentes de leite forem substituídos pelos dentes definitivos, a cárie do biberão será resolvida. Esta é apenas uma situação ideal, desde que a cárie de biberão em si não seja grave ou seja tratada adequadamente, mas se o bebé tiver cárie de biberão e não for tratado adequadamente o mais cedo possível, pode afectar os dentes permanentes. Isto deve-se ao facto de a maioria das crianças com cáries de biberão serem jovens, antes dos 3 anos de idade. Se os dentes de leite cariados não forem tratados o mais rapidamente possível, isso causará uma cárie extensa dos dentes de leite e pode mesmo levar à perda da maioria dos dentes de leite na boca. A cárie severa dos dentes de leite pode levar a uma inflamação apical crónica dos dentes de leite, o que pode levar a um fraco desenvolvimento da coroa dos dentes permanentes e à formação dos dentes de Turner. A perda prematura dos dentes de leite pode causar espaço insuficiente para a erupção dos dentes permanentes, resultando em desalinhamento dos dentes permanentes após a erupção. Deste ponto de vista, a cárie de mamadeira também precisa ser tratada o mais cedo possível, em vez de esperar que ela se substitua, pois isso é muitas vezes mais caro do que vale a pena.