A ressonância magnética é um exame tomográfico que divide o corpo em camadas de imagens, desde a imagem sagital, coronal ou axial. O princípio da imagem é colocar o corpo num campo magnético especial e produzir imagens através da ressonância de núcleos de hidrogénio, mas o PET-CT é diferente na medida em que é uma modalidade de imagem de medicina nuclear que injecta elementos radioactivos nucleares no corpo e adquire imagens através da emissão de raios do corpo, pelo que PET-CT é uma imagem grosseira do corpo a nível metabólico. É agora geralmente utilizado clinicamente para verificar a existência de doenças neoplásicas ou a presença de metástases em todo o corpo, e é mais amplamente utilizado. A ressonância magnética e a imagem PET-CT são duas modalidades de imagem completamente diferentes, com diferentes métodos de imagem e análise de imagem, e por isso têm diferentes aplicações clínicas.