Existem várias causas para a displasia folicular: a primeira são os problemas hipofisários, uma das causas da displasia folicular. Os distúrbios comuns que levam a uma ovulação anormal incluem o prolactinoma hipofisário, a hiperprolactinemia e a síndrome de Silhan, em que níveis elevados de prolactina podem inibir a ovulação. O segundo, uma anovulação hipotalâmica, é um factor orgânico primário, um factor funcional primário, uma lesão orgânica secundária e um factor funcional secundário, todos os quais podem levar à anovulação hipotalâmica. Em terceiro lugar, a falência ovárica prematura. Em algumas mulheres, a displasia folicular é causada por uma falência ovárica prematura. As doentes têm uma menstruação precoce normal e até uma história de fertilidade, mas depois têm uma menstruação esporádica e até uma amenorreia gradual. Nestes casos, os folículos nos ovários estão esgotados e já não é possível desenvolvê-los com medicamentos ovulatórios, ou podem ter folículos primordiais mas que não respondem às gonadotrofinas. A quarta é a síndrome dos ovários poliquísticos, que é uma das causas da má ovulação. A quinta, como a obesidade excessiva, o stress mental ou outros factores de saúde, também pode levar a perturbações endócrinas nas mulheres, que podem afectar o desenvolvimento dos folículos.