A eliminação da hidrocefalia após craniotomia deve ser avaliada de acordo com a situação no momento, uma vez que o estado de cada doente é diferente. Em geral, se a hidrocefalia após craniotomia for uma hidrocefalia aguda, ou seja, se os sintomas se alterarem muito rapidamente e se tornarem gradualmente mais graves, tem de ser removida cirurgicamente, geralmente por punção extra-ventricular e drenagem, que é a forma mais rápida e eficaz de a remover. No caso da hidrocefalia crónica, recorre-se normalmente à cirurgia de derivação ventrículo-peritoneal, o que significa que o líquido cefalorraquidiano é drenado artificialmente do crânio para a cavidade abdominal e absorvido através da cavidade abdominal.