A maior parte da diarreia durante a menstruação é de natureza fisiológica. Durante a menstruação, os níveis hormonais alteram-se significativamente e as prostaglandinas endometriais aumentam, provocando a contracção do útero, espasmos vasculares, isquémia e hipoxia locais e dor abdominal. As prostaglandinas aumentadas entram na corrente sanguínea e propagam-se aos tecidos circundantes, como o tracto digestivo e o sistema cardiovascular. Algumas mulheres sensíveis podem ter diarreia, dores abdominais, náuseas, vómitos, mãos e pés frios. Pode beber mais água quente para promover o metabolismo e evitar alimentos frios, condimentados e gordurosos para não agravar a situação. As compressas quentes no abdómen e a imersão em água quente nos pés podem aliviar os sintomas. A diarreia ocasional durante a menstruação está relacionada com uma alimentação incorrecta ou com falta de higiene e pode ser observada durante alguns ciclos menstruais. Em casos graves, podem ser tomados medicamentos orais sob a orientação de um médico se não houver uma melhoria significativa após a modificação da vida.