Granuloma eosinofílico do crânio, a primeira coisa a considerar é a cirurgia. Trata-se de uma lesão benigna do crânio e não é um tumor maligno. No entanto, cresce e invade o crânio normal do doente, provocando um defeito craniano cada vez maior, que é normalmente diagnosticado de forma definitiva com uma TAC craniana. Normalmente, o doente sente uma massa no couro cabeludo e, no exame físico efectuado pelo neurocirurgião, é encontrado um defeito craniano correspondente, que é elevado e dúctil no crânio. Neste caso, a excisão cirúrgica deve ser activamente considerada para o tratamento. Durante a cirurgia, não só é removido o granuloma eosinofílico, como também é removido o correspondente rebordo craniano normal. Depois de todas as lesões terem sido removidas, a reparação craniana é considerada em simultâneo, sendo normalmente dada prioridade à reparação craniana com malha de titânio.