Os tomates crus são geralmente inofensivos, mas podem causar perturbações gastrointestinais se forem ingeridos sem serem lavados.
O tomate cru é geralmente inofensivo para pessoas saudáveis que não são alérgicas ao tomate.
Contudo, dever-se-á ter em conta que os tomates devem ser sempre lavados quando são consumidos crus. Devido às características de crescimento da planta de tomate, por vezes não consegue obter luz solar suficiente, e é fácil de ser anexado ao solo com Salmonella, estes casos são fáceis de comer dor abdominal, diarreia. Além disso, pode haver resíduos de pesticidas que entram no corpo e prejudicam o organismo se não forem limpos.
Tomates crus, embora geralmente não sejam prejudiciais, mas devem ter cuidado para não comer tomates crus (os tomates verdes em geral), os tomates crus conterão uma pequena quantidade de licopeno, depois de comer podem ter tonturas, náuseas, desempenho de vómitos.