Na prática clínica, existem muitos tipos diferentes de DST nas mulheres e não é possível seguir uma abordagem puramente terapêutica que permita tratar relativamente bem todos eles. Por exemplo, a candidíase genital, a tricomoníase genital e a vaginite bacteriana requerem a administração de medicamentos antifúngicos e antibacterianos por via oral ou vaginal. No caso da gonorreia, por exemplo, os medicamentos de eleição são as cefalosporinas e as quinolonas, que são administradas por via oral ou intravenosa. Para a sífilis, utiliza-se em primeiro lugar a penicilina de longa duração de acção, sendo a penicilina benzatina a mais utilizada clinicamente. No caso do herpes genital, são utilizados em primeiro lugar medicamentos antivirais, como o aciclovir, o valaciclovir e o famciclovir.