Quando um cateter é inserido, a mucosa uretral fica irritada pelo cateter e provoca uma resposta local à dor da mucosa, pelo que a dor pode ocorrer durante a inserção do cateter, especialmente se o doente não estiver a cooperar bem, tal como quando a mucosa uretral ou o esfíncter da uretra se contrai violentamente após tensão excessiva ou dor ligeira, o que depois faz com que a mucosa uretral se enrole firmemente à volta do cateter. Durante a inserção do cateter, a dor é aumentada a fim de superar a resistência da mucosa, especialmente em homens com hiperplasia prostática combinada que têm graus variáveis de estricção uretral, de modo que o cateter uretral é ligeiramente ou severamente doloroso ao passar pela secção estriccionada. Para alguns doentes com estricções uretrais externas, encopresis ou infecções do tracto urinário, também pode haver dor significativa durante a inserção do cateter, que é causada pela irritação da mucosa local pelo cateter. Estas dores são causadas pela irritação da mucosa local. É normalmente necessário prevenir a infecção após a inserção do cateter, beber muita água e adaptar-se ao cateter.