No caso de úlceras de amígdalas, pode ser devido a uma infecção ou a uma falta de vitaminas B no corpo. Pode tomar vitamina B2 ou multivitaminas oralmente, e depois utilizar um spray bucal anti-inflamatório, como o Golden Throat, ou comprimidos anti-inflamatórios, como os comprimidos Huasu, topicamente na boca. Isto também pode ser combinado com ultra-sons, terapia inalatória nebulizada ou gargarejo anti-inflamatório bucal pode proporcionar alívio. Se a úlcera bucal for acompanhada de inflamação aguda, além dos medicamentos acima mencionados, os antibióticos podem ser utilizados conforme apropriado, dependendo do grau de inflamação e infecção. Recomenda-se a utilização de cefalosporinas. Úlceras bucais recorrentes ou grandes úlceras bucais onde o tratamento conservador não é eficaz podem também ser tratadas com terapia hormonal para ajudar à recuperação.