A inflamação crónica da bexiga caracteriza-se em última análise pela incapacidade de reparar a mucosa vesical secundária a uma infecção aguda, quando a infecção aguda causou erosão da mucosa vesical ou destruição da camada de aminoácidos na superfície. Isto pode levar a dores crónicas, micção frequente, urgência, uma sensação de retenção de urina ou uma sensação de micção incompleta. Neste ponto do exame não há infecção aguda e os sintomas do doente não são pesados e relativamente leves, mas não desaparecem completamente, pelo que frequentemente causam uma redução na qualidade de vida e podem causar sintomas como ansiedade ou carga psicológica. A cistite crónica é mal tratada ou ineficaz, pelo que os pacientes podem ter irritação do tracto urinário durante meses ou anos sem estarem completamente curados, e o processo de tratamento tem de ser abrangente, com psicoterapia ou fisioterapia, além do tratamento convencional.