Para o aparecimento de pneumonia por micoplasma, os doentes escolhem geralmente a azitromicina e a eritromicina. O efeito destes dois fármacos depende principalmente da pneumonia, para a qual o antibiótico é mais sensível. Em geral, na clínica, a utilização de antibióticos é menor e, na primeira infeção por Mycoplasma pneumoniae e causada por pneumonia, o efeito da azitromicina ou da eritromicina é melhor. Alguns doentes, devido à utilização prolongada de antibióticos, tais como a utilização prolongada do tratamento com azitromicina, podem provocar a resistência do micoplasma à azitromicina, pelo que pode ser necessário escolher o efeito da eritromicina nunca utilizada. Clinicamente, as secreções respiratórias podem ser submetidas a um teste de sensibilidade aos medicamentos contra o micoplasma. De acordo com os resultados do teste, é possível escolher antibióticos mais sensíveis para melhorar a eficácia do tratamento e distinguir os antibióticos mais eficazes.